Protéomique et microbiologie

Chef de Service : Prof. Dr. Ruddy Wattiez

Autres membres permanents :
David Gillan (Chargé de cours)
Baptiste Leroy (Chef de Travaux)

Les protéines jouent un rôle fondamental dans une cellule, qu’elle soit eucaryote ou procaryote. L’étude des polypeptides, macromolécules hautement structurées, est donc essentiel pour mieux comprendre les mécanismes cellulaires qu’ils soient pathologiques ou non, aussi bien chez un organisme unicellulaire que multicellulaire. Dans ce contexte, le Laboratoire de Protéomique et Microbiologie s’est spécialisé dans l’étude des relations structure-fonction des protéines et s’est focalisé depuis de nombreuses années sur un modèle particulier de cellules que sont les bactéries. Fort de cette expérience, le laboratoire s’est ouvert à d’autres modèles (humain, souris,..), généralement en collaboration avec d’autres unités de recherche. Toujours à la pointe des développements technologiques (spectrométrie de masse à haute résolution, etc.), le laboratoire est devenu une référence concernant les approches expérimentales permettant d’aborder l’aspect fonctionnel d’une cellule dans son ensemble (Protéomie fonctionnelle, structurale et quantitative). Ces approches nous permettent actuellement d’étudier le fonctionnement de certaines bactéries en se focalisant d’une part sur les mécanismes de résistance aux métaux et d’autre part sur certains métabolismes comme le métabolisme de l’azote et des acides gras chez certaines bactéries photosynthétiques. Du prélèvement sur le terrain aux cultures en laboratoire, combinés aux analyses génomiques, le laboratoire développe actuellement les approches protéomiques pour mieux comprendre et modéliser les consortiums bactériens et leur évolution en présence de composés toxiques comme les métaux.

Ces expertises, le laboratoire les utilise également dans des recherches et développements dans les domaines de la biotechnologie et de la santé. La mise en évidence de biomarqueurs de nature protéique ou le développement de biosenseurs font partie des recherches menées au sein du laboratoire.

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